Theo thông tin từ Ban Chỉ huy Phòng thủ dân sự tỉnh Quảng Trị, đến 6h cùng ngày, phần lớn các sông trên địa bàn đã qua đỉnh và đang giảm chậm. Riêng sông Gianh vẫn tiếp tục lên. Tại trạm Thạch Hãn, đỉnh lũ ghi nhận 6,31m vào tối 13/9, cao hơn báo động 3 khoảng 0,31m.

Tình trạng ngập và chia cắt được ghi nhận tại nhiều xã, phường như La Lay, A Dơi, Đakrông, Trường Sơn, Lìa, Hướng Phùng, Kim Ngân, Kim Phú, Hướng Hiệp, Tân Lập, Khe Sanh và Vĩnh Ô.
Một số địa bàn chịu ảnh hưởng đáng kể. Xã Lao Bảo có 312 nhà với 1.090 người bị ngập; phường Quảng Trị có 105 nhà với 404 người, trong đó 5 nhà ngập trên 1m. Tại xã Ba Lòng, 126 nhà với 437 người bị ảnh hưởng bởi nước ngập từ 0,1 đến 2,1m. Nam Hải Lăng ghi nhận 48 nhà bị ngập.
Trước diễn biến mưa lũ, các địa phương đã đưa 663 hộ, tương ứng 2.506 người, đến nơi an toàn. Trong đó, Lao Bảo sơ tán 333 hộ, Ba Lòng 163 hộ và Lìa 140 hộ. Những khu vực có nguy cơ sạt lở cao cũng được lực lượng chức năng chủ động di chuyển người dân.

Giao thông tiếp tục gặp nhiều khó khăn. Có 10 vị trí trên các tuyến quốc lộ và đường do ngành xây dựng quản lý bị ngập hoặc tắc. Cầu tràn Ba Lòng trên ĐT.588a bị ngập hơn 5m; một số ngầm, tràn trên ĐT.586, ĐT.587 và ĐT.571 ngập từ 0,3 đến 1m, khiến phương tiện không thể lưu thông.
Sạt lở cũng xuất hiện tại một số tuyến đường. Khoảng 40m³ đất đá sạt xuống tại Km10 Quốc lộ 15D, tuyến lên Cửa khẩu quốc tế La Lay. Tuyến đường liên xã Khe Sanh - Hướng Phùng bị sạt lở, sụt lún khoảng 15m.
Một sự cố đáng chú ý xảy ra chiều 13/9 khi nước sông Ô Giang dâng cao, chảy mạnh cuốn 3 sà lan về phía hạ lưu. Các sà lan sau đó mắc tại khu vực cầu đường sắt Mỹ Chánh, xã Nam Hải Lăng, tạo nguy cơ ảnh hưởng đến hoạt động đường sắt, Quốc lộ 1A và giao thông đường thủy. Tỉnh Quảng Trị đã yêu cầu chuẩn bị lực lượng, phương tiện để xử lý và trục vớt.

Mưa lũ cũng gây ảnh hưởng đến sản xuất nông nghiệp. Thống kê ban đầu cho thấy 344,5ha lúa bị ngập, đổ ngã và 12,5ha hoa màu bị ngập. Một số ao, hồ nuôi cá tại Tân Lập, Khe Sanh bị vỡ bờ hoặc tràn nước.
Các lực lượng chức năng đang tiếp tục kiểm soát những khu vực ngập sâu, nước chảy xiết và điểm có nguy cơ sạt lở; đồng thời bố trí cảnh giới, rào chắn nhằm hạn chế người và phương tiện đi vào khu vực nguy hiểm.